Акерке Ахметова родилась в 1975 году в Алматы. Окончила Кокшетауский педагогический институт им. Ш. Валиханова, Карагандинский Государственный Университет им. Е. А. Букетова, Академию государственного управления при Президенте РК, The University of Sheffield в Великобритании по программе «Болашак».
Трудовую деятельность начала в 1991 году на коммерческих предприятиях Кокшетау.
С 2000 по 2015 год работала главным специалистом, начальником отдела экспертизы проектов международных договоров, заместителем директора Департамента аналитики и правовой пропаганды, заместителем директора Департамента стратегического планирования и организационно-аналитической работы Министерства юстиции РК.
С 2015 по 2017 год — директор Департамента международного права и сотрудничества Министерства юстиции РК. С 2018 по 2019 год — директор Департамента по защите имущественных прав государства Министерства юстиции РК. С сентября 2019 года по настоящее время занимала должность вице-министра юстиции РК.